Learning from mistakes: challenges in finding holobiont factors from environmental samples and the importance of methodological consistency

Primer Autor
Yarimizu, Kyoko
Co-autores
Fujiyoshi, So
Perera, Ishara
Abanto, Michel
Jorquera, Milko
Maruyama, Fumito
Título
Learning from mistakes: challenges in finding holobiont factors from environmental samples and the importance of methodological consistency
Editorial
ELSEVIER SCI LTD
Revista
CURRENT OPINION IN BIOTECHNOLOGY
Lenguaje
en
Resumen
The cause of harmful algal blooms has been a mystery, but research to elucidate its mechanism has progressed over the years thanks to genetic technologies. We have monitored toxic algae and its associated bacteria as a community, the so-called 'holobiont' in Chilean coastal waters for years from the perspective of bacteria as an algal bloom driver. This review describes the challenges of holobiont monitoring, specifically with respect to standardizing and compliance with the monitoring protocols to collect reliable and sustainable data. Further, we suggest adopting the high-throughput sequencing (HTS) standard operating procedure (SOP) by the International Human Microbiome to improve the quality and consistency of holobiont monitoring in the harmful algal world.
Fecha Publicación
2023
Tipo de Recurso
artículo de revisión
doi
10.1016/j.copbio.2023.102897
Formato Recurso
PDF
Palabras Claves
holobionts - monitoring
harmful algae
Ubicación del archivo
http://dx.doi.org/10.1016/j.copbio.2023.102897
Categoría OCDE
Bioquímica y biología molecular
Biotecnología y microbiología aplicada
Materias
holobiontes - monitoreo
algas nocivas
Identificador del recurso (Mandatado-único)
artículo de revisión
Versión del recurso (Recomendado-único)
versión publicada
License
CC BY-NC-ND 4.0
Condición de la licencia (Recomendado-repetible)
CC BY-NC-ND 4.0
Derechos de acceso
acceso abierto
Access Rights
acceso abierto
Id de Web of Science
WOS:000931048200001
ISSN
0958-1669
Tipo de ruta
verde# hibrida
Categoría WOS
Bioquímica y biología molecular
Biotecnología y microbiología aplicada
Colecciones
Colección Publicaciones Científicas
Colección ANID
Revisa las metricas alternativas de Almetrics
Revisa las citaciones de Dimensions