Repositorio UFRO · Omeka S

Differentially expressed genes induced by cold and UV-B in Deschampsia antarctica Desv.

Primer Autor	Gutierrez-Moraga, Ana
Co-autores	Dinamarca, Jorge Sandoval-Alvarez, Alejandra Gidekel, Manuel
Título	Differentially expressed genes induced by cold and UV-B in Deschampsia antarctica Desv.
Editorial	SPRINGER
Revista	POLAR BIOLOGY
Lenguaje	en
Resumen	Antarctica is one of the most extreme environments on Earth. Deschampsia antarctica Desv. is the only monocot vascular plant that colonizes the Antarctic Peninsula. The survival of this species in this harsh environment suggests that this plant possesses genes associated with cold and UV tolerance. Using suppression subtractive hybridization, we identified a total of 112 differentially expressed genes under cold and UV irradiance conditions. Northern blot analysis and real-time RT-PCR confirmed expression differences among several genes. Using similarity search analysis, we identified a number of genes that have not been previously reported. The results showed that cold and UV radiation mainly induce the expression of genes related to transcription, energy and defense response. Interestingly, part of the isolated genes corresponds to unknown or hypothetical proteins. This set of tolerance-related genes could be relevant to uncover the mechanisms by which this extremophile survives in its environment and contribute to the development of biotechnology in Antarctic species.
Tipo de Recurso	Artículo original
Description	The authors thank Leon Bravo for his helpful discussions and critical reading of the manuscript. The authors thank Charles Guy for his help in the translation and proofreading of the manuscript. This work was supported by Fondo de Fomento al Desarrollo Cientifico y Tecnologico (FONDEF project D03I-1079), the Antarctic Chilean Institute (INACH project 01-03-Part II), INNOVA BIOBIO project 04-B1-283 L1, Consorcio de Tecnologia e Innovacion para la Salud (PBCT CTE-06). JD was also supported by the Programa Bicentenario-Banco Mundial, CONICYT, Chile PBCT CTE-06. Los autores agradecen a Leon Bravo por sus valiosas discusiones y la revisión crítica del manuscrito. Asimismo, agradecen a Charles Guy por su ayuda en la traducción y corrección del manuscrito. Este trabajo fue financiado por el Fondo de Fomento al Desarrollo Científico y Tecnológico (FONDEF, proyecto D03I-1079), el Instituto Antártico Chileno (INACH, proyecto 01-03-Parte II), INNOVA BIOBIO, proyecto 04-B1-283 L1 y el Consorcio de Tecnología e Innovación para la Salud (PBCT CTE-06). JD también recibió apoyo del Programa Bicentenario-Banco Mundial, CONICYT, Chile PBCT CTE-06.
doi	10.1007/s00300-012-1271-7
Formato Recurso	pdf
Palabras Claves	Induced genes Suppression subtractive hybridization Cold and UV-B tolerance Antarctica SUPPRESSION SUBTRACTIVE HYBRIDIZATION STRESS RESPONSES FREEZING TOLERANCE PROTEOMIC ANALYSIS DNA-DAMAGE RADIATION ACCLIMATION PLANTS SEQUENCE LIGHT Genes inducidos Hibridación sustractiva de supresión Tolerancia al frío y a la radiación UV-B Antártida HIBRIDACIÓN SUSTRACTIVA POR SUPRESIÓN RESPUESTAS AL ESTRÉS TOLERANCIA A LA CONGELACIÓN ANÁLISIS PROTEÓMICO DAÑO AL ADN RADIACIÓN ACLIMATACIÓN PLANTAS SECUENCIA LUZ
Ubicación del archivo	http://dx.doi.org/10.1007/s00300-012-1271-7
Materias	Induced genes Suppression subtractive hybridization Cold and UV-B tolerance Antarctica SUPPRESSION SUBTRACTIVE HYBRIDIZATION STRESS RESPONSES FREEZING TOLERANCE PROTEOMIC ANALYSIS DNA-DAMAGE RADIATION ACCLIMATION PLANTS SEQUENCE LIGHT Genes inducidos Hibridación sustractiva de supresión Tolerancia al frío y a la radiación UV-B Antártida HIBRIDACIÓN SUSTRACTIVA POR SUPRESIÓN RESPUESTAS AL ESTRÉS TOLERANCIA A LA CONGELACIÓN ANÁLISIS PROTEÓMICO DAÑO AL ADN RADIACIÓN ACLIMATACIÓN PLANTAS SECUENCIA LUZ
Disciplinas de la OCDE	Biotecnología agrícola Biología Molecular Genética y Herencia
Título de la cita (Recomendado-único)	Differentially expressed genes induced by cold and UV-B in Deschampsia antarctica Desv.
Revista/Libro	POLAR BIOLOGY
Tipo de ruta	hibrida verde
Access Rights	restringido
Derechos de acceso	restringido
Idioma	en
Identificador del recurso (Mandatado-único)	Artículo original
Versión del recurso (Recomendado-único)	versión publicada
Entidad financiadora	ANID CONICYT FONDEF D03I-1079#INACH 01-03-Part II#INNOVA BIOBIO 004-B1-283 L1#Consorcio de Tecnologia e Innovacion para la Salud PBCT CTE-06#Programa Bicentenario-Banco Mundial, CONICYT, Chile PBCT CTE-06
Referencia del Financiador (Mandatado si es aplicable-repetible)	ANID CONICYT FONDEF D03I-1079 INACH 01-03-Part II INNOVA BIOBIO 004-B1-283 L1 Consorcio de Tecnologia e Innovacion para la Salud PBCT CTE-06 Programa Bicentenario-Banco Mundial, CONICYT, Chile PBCT CTE-06
Editorial	SPRINGER
ISSN	0722-4060
Página de inicio (Recomendado-único)	409
Página final (Recomendado-único)	418
Categoría WOS	Conservación de la biodiversidad Ecología Biodiversity Conservation Ecology
Formato	pdf
Id de Web of Science	WOS:000314852300010