Repositorio UFRO · Omeka S

Detection of aluminium tolerance plasmids and microbial diversity in the rhizosphere of plants grown in acidic volcanic soil

Primer Autor	Jorquera, Milko A.
Co-autores	Hernandez, Marcela Martinez, Oscar Marschner, Petra de la Luz Mora, Maria
Título	Detection of aluminium tolerance plasmids and microbial diversity in the rhizosphere of plants grown in acidic volcanic soil
Editorial	ELSEVIER FRANCE-EDITIONS SCIENTIFIQUES MEDICALES ELSEVIER
Revista	EUROPEAN JOURNAL OF SOIL BIOLOGY
Lenguaje	en
Resumen	La rizosfera se considera un punto clave para el intercambio genético entre bacterias en ecosistemas terrestres. Los suelos volcánicos chilenos se caracterizan por un pH bajo y altas concentraciones de aluminio (Al) en la solución del suelo, por lo que la tolerancia al Al podría ser importante para la supervivencia de los microorganismos en estos suelos: la pérdida de genes que codifican la tolerancia al Al puede afectar la competitividad, particularmente en la rizosfera, donde la competencia es intensa. Se investigó la presencia de plásmidos de tolerancia al Al en las rizosferas de pastos y cultivos que crecen en suelos volcánicos ácidos del sur de Chile. Los plásmidos de tolerancia al Al se capturaron mediante conjugación biparental. Se pudieron distinguir dos tipos de plásmidos de tolerancia al Al, según su patrón de restricción de endonucleasa. Se seleccionó un plásmido de cada grupo (denominado pRPA21 y pOPA21) para estudios posteriores. Los plásmidos mostraron una alta estabilidad en presencia y ausencia de Al. Además, se evaluó la composición de la comunidad microbiana en los suelos de la rizosfera mediante electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante (DGGE). La secuenciación de las bandas de DGGE reveló, entre otros, miembros del filo bacteriano Gemmatimonadetes y del filo arqueal Crenarchaeota. El presente estudio demuestra que la rizosfera de pastos y cultivos que crecen en suelo volcánico chileno alberga elementos genéticos móviles que podrían influir en la adaptación de las poblaciones bacterianas a factores de estrés ambiental, como la toxicidad del aluminio. © 2010 Elsevier Masson SAS. Todos los derechos reservados.#The rhizosphere is considered as a hot-spot for gene exchange among bacteria in terrestrial ecosystems. Chilean volcanic soils are characterized by low pH and high concentrations of aluminium (Al) in the soil solution, thus Al tolerance could be important for the survival of microorganisms in these soils: loss of genes encoding for Al tolerance may affect competitiveness particularly in the rhizosphere where competition is strong. The occurrence of Al-tolerance plasmids was investigated in the rhizospheres of pasture and crop plants growing in acidic volcanic soils from southern Chile. Al tolerance plasmids were captured by biparental mating. Two types of Al tolerance plasmids could be distinguished, based on their endonuclease restriction pattern. One plasmid of each group (denoted as pRPA21 and pOPA21) was selected for further studies. The plasmids showed a high stability in presence and absence of Al. Additionally, microbial community composition in the rhizosphere soils was assessed by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Sequencing of DGGE bands revealed among others, members of the bacterial phylum Gemmatimonadetes and archaeal phylum Crenarchaeota. The present study shows that the rhizosphere of pasture and crop plants growing in Chilean volcanic soil harbors genetic mobile elements which could play a role in the adaptation of bacterial populations to environmental stressors, such as Al-toxicity. (C) 2010 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.
Tipo de Recurso	Artículo original
Description	Los autores agradecen el apoyo del Programa del Bicentenario en Ciencia y Tecnología (Proyecto PSD26), el Proyecto de Investigación Regular FONDECYT n.° 1061262 y el Proyecto de Cooperación Internacional FONDECYT n.° 7060093. Asimismo, agradecen las valiosas sugerencias del editor y de tres revisores anónimos para mejorar la calidad de este trabajo. M. Hernández y O. Martínez agradecen las becas de doctorado de CONICYT.
doi	10.1016/j.ejsobi.2010.03.005
Formato Recurso	pdf
Palabras Claves	Acidic soils Aluminium tolerance Microbial community Plasmid Rhizosphere HORIZONTAL GENE-TRANSFER BACTERIAL COMMUNITY PSEUDOMONAS-FLUORESCENS ANTIBIOTIC-RESISTANCE RIBOSOMAL-RNA IN-SITU PREVALENCE STABILITY POPULATIONS IMPACT Suelos ácidos Tolerancia al aluminio Comunidad microbiana Plásmido Rizosfera TRANSFERENCIA HORIZONTAL DE GENES COMUNIDAD BACTERIANA PSEUDOMONAS FLUORESCENS RESISTENCIA A ANTIBIÓTICOS ARN RIBOSOMAL IN SITU PREVALENCIA ESTABILIDAD POBLACIONES IMPACTO
Ubicación del archivo	http://dx.doi.org/10.1016/j.ejsobi.2010.03.005
Categoría OCDE	Ecology Soil Science
Materias	Acidic soils Aluminium tolerance Microbial community Plasmid Rhizosphere HORIZONTAL GENE-TRANSFER BACTERIAL COMMUNITY PSEUDOMONAS-FLUORESCENS ANTIBIOTIC-RESISTANCE RIBOSOMAL-RNA IN-SITU PREVALENCE STABILITY POPULATIONS IMPACT Suelos ácidos Tolerancia al aluminio Comunidad microbiana Plásmido Rizosfera TRANSFERENCIA HORIZONTAL DE GENES COMUNIDAD BACTERIANA PSEUDOMONAS FLUORESCENS RESISTENCIA A ANTIBIÓTICOS ARN RIBOSOMAL IN SITU PREVALENCIA ESTABILIDAD POBLACIONES IMPACTO
Versión del recurso (Recomendado-único)	versión publicada
Tipo de ruta	hibrida
Access Rights	restringido
Derechos de acceso	restringido
Id de Web of Science	WOS:000279292900011
Título de la cita (Recomendado-único)	Detection of aluminium tolerance plasmids and microbial diversity in the rhizosphere of plants grown in acidic volcanic soil
Identificador del recurso (Mandatado-único)	Artículo original
Editorial	ELSEVIER FRANCE-EDITIONS SCIENTIFIQUES MEDICALES ELSEVIER
Revista/Libro	EUROPEAN JOURNAL OF SOIL BIOLOGY
Categoría WOS	Ecología Ciencia del suelo Ecology Soil Science
Idioma	en
ISSN	1164-5563
Entidad financiadora	Bicentenary Program in Science and Technology PSD26#FONDECYT 1061262, 7060093#CONICYT
Referencia del Financiador (Mandatado si es aplicable-repetible)	Bicentenary Program in Science and Technology PSD26#FONDECYT 1061262, 7060093#CONICYT
Página de inicio (Recomendado-único)	255
Página final (Recomendado-único)	263
Formato	pdf