Repositorio UFRO · Omeka S

Differential gene expression in proteoid root clusters of white lupin (Lupinus albus)

Primer Autor	Peñaloza, E
Co-autores	Gutierrez, A Martínez, J Muñoz, G Bravo, LA Corcuera, LJ
Título	Differential gene expression in proteoid root clusters of white lupin (Lupinus albus)
Editorial	WILEY
Revista	PHYSIOLOGIA PLANTARUM
Lenguaje	en
Resumen	Proteoid root clusters are induced by P deficiency in white lupin. In their mature stage, these roots excrete organic acids (mainly citrate), thus allowing this species to acquire P from sparingly soluble sources. To screen for P-regulated genes expressed during the period of citrate efflux, an experimental model based on proteoid root clusters contrasting in citrate efflux was developed. The feasibility of this model in identifying differential gene expression was assessed over a population of mRNAs from P-starved and P-starved rescued proteoid root clusters, sampled 24 and 72 h after P addition to 24 days P-starved white lupin. Approximately 1500 bands of cDNA were displayed by differential display of 21-primer pair's combination 52 differentially expressed bands, either up- or down-regulated after P addition, were observed. Sequence analysis of 17 of them revealed that they represent distinct cDNAs. A subsample of seven cDNAs was analysed by northern-blot, showing that six were truly differential products. Transcripts coding for enzymes involved in carbon flux (glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase), glycolytic bypass (phosphoenolpyruvate carboxylase), P-i recycling (sulpholipid synthase), and two unknown cDNAs were shown to be down-regulated by P supply. Besides, an up-regulated transcript coding for a putative auxin-induced protein was identified, whereas P addition did not significantly affect expression of a transcript for cyclophilins. These results show the feasibility of using P-starved and P-starved rescued proteoid root clusters as an experimental model to detect and examine the molecular changes occurring in root clusters during the period of citrate efflux in white lupin. Los cúmulos de raíces proteoides son inducidos por la deficiencia de P en el lupino blanco. En su etapa madura, estas raíces excretan ácidos orgánicos (principalmente citrato), lo que permite a esta especie adquirir P de fuentes poco solubles. Para buscar genes regulados por P expresados durante el período de eflujo de citrato, se desarrolló un modelo experimental basado en cúmulos de raíces proteoides con eflujo de citrato contrastante. La viabilidad de este modelo para identificar la expresión génica diferencial se evaluó en una población de ARNm de cúmulos de raíces proteoides con deficiencia de P y con deficiencia de P recuperada, muestreados 24 y 72 h después de la adición de P a lupino blanco con deficiencia de P durante 24 días. Aproximadamente 1500 bandas de ADNc fueron mostradas por la visualización diferencial de la combinación de 21 pares de cebadores se observaron 52 bandas expresadas diferencialmente, ya sea reguladas al alza o a la baja después de la adición de P. El análisis de secuencia de 17 de ellas reveló que representan ADNc distintos. Se analizó una submuestra de siete cDNA mediante Northern blot, demostrando que seis eran productos diferenciales. Se observó que los transcritos que codifican enzimas implicadas en el flujo de carbono (gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa), la derivación glucolítica (fosfoenolpiruvato carboxilasa), el reciclaje de P-i (sulfolípido sintasa) y dos cDNA desconocidos se regulaban negativamente por el suministro de P. Además, se identificó un transcrito regulado positivamente que codifica una proteína putativa inducida por auxina, mientras que la adición de P no afectó significativamente la expresión de un transcrito de ciclofilinas. Estos resultados demuestran la viabilidad de utilizar cúmulos de raíces proteoides con deficiencia de P y con deficiencia de P recuperada como modelo experimental para detectar y examinar los cambios moleculares que ocurren en los cúmulos de raíces durante el período de eflujo de citrato en el lupino blanco.
Tipo de Recurso	artículo original
doi	10.1034/j.1399-3054.2002.1160104.x
Formato Recurso	PDF
Palabras Claves	METABOLISMO INDUCIBLE POR INHAMBRUNA LYCOPERSICON-ESCULENTUM DEFICIENCIA DE FÓSFORO FOSFATASA ÁCIDA BIOSÍNTESIS EXCRECIÓN DISPONIBILIDAD RIZOSFERA ADAPTACIONES EXUDACIÓN STARVATION INDUCIBLE METABOLISM LYCOPERSICON-ESCULENTUM PHOSPHORUS DEFICIENCY ACID-PHOSPHATASE BIOSYNTHESIS EXCRETION AVAILABILITY RHIZOSPHERE ADAPTATIONS EXUDATION
Ubicación del archivo	http://dx.doi.org/10.1034/j.1399-3054.2002.1160104.x
Categoría OCDE	Plant Sciences
Materias	METABOLISMO INDUCIBLE POR INHAMBRUNA LYCOPERSICON-ESCULENTUM DEFICIENCIA DE FÓSFORO FOSFATASA ÁCIDA BIOSÍNTESIS EXCRECIÓN DISPONIBILIDAD RIZOSFERA ADAPTACIONES EXUDACIÓN STARVATION INDUCIBLE METABOLISM LYCOPERSICON-ESCULENTUM PHOSPHORUS DEFICIENCY ACID-PHOSPHATASE BIOSYNTHESIS EXCRETION AVAILABILITY RHIZOSPHERE ADAPTATIONS EXUDATION
Disciplinas de la OCDE	Botánica Biología Molecular Otras Especialidades de la Biología
Versión del recurso (Recomendado-único)	version publicada
Tipo de ruta	hibrida
Access Rights	restringido
Derechos de acceso	restringido
Id de Web of Science	WOS:000177790100004
Título de la cita (Recomendado-único)	Differential gene expression in proteoid root clusters of white lupin (Lupinus albus)
Identificador del recurso (Mandatado-único)	artículo original
Editorial	WILEY
Categoría WOS	Plant Sciences Ciencias de las plantas
Idioma	en
ISSN	0031-9317
Revista/Libro	PHYSIOLOGIA PLANTARUM
Identificador alternativo	PMID:12207659
Página de inicio (Recomendado-único)	28
Página final (Recomendado-único)	36
Formato	PDF