Repositorio UFRO · Omeka S

Identification and characterization of three novel cold acclimation-responsive genes from the extremophile hair grass Deschampsia antarctica Desv.

Primer Autor	Gutiérrez, A
Co-autores	Gidekel, M Destefano-Beltrán, L García, P Mujica, L Leal, P Cuba, M Fuentes, L Bravo, LA Corcuera, LJ Alberdi, M Concha, I
Título	Identification and characterization of three novel cold acclimation-responsive genes from the extremophile hair grass Deschampsia antarctica Desv.
Editorial	SPRINGER JAPAN KK
Revista	EXTREMOPHILES
Lenguaje	en
Resumen	Deschampsia antarctica Desv. is the only monocot that thrives in the harsh conditions of the Antarctic Peninsula and represents an invaluable resource for the identification of genes associated with freezing tolerance. In order to identify genes regulated by low temperature, we have initiated a detailed analysis of its gene expression. Preliminary 2-D gels of in vivo-labeled leaf proteins showed qualitative and quantitative differences between cold-acclimated and non-acclimated plants, suggesting differential gene expression. Similarly, cold-acclimation-related transcripts were screened by a differential display method. Of the 38 cDNAs initially identified, three cDNA clones were characterized for their protein encoding, expression pattern, response to several stresses, and for their tissue-specific expression. Northern blot analysis of DaGrx, DaRub1, and DaPyk1 encoding a glutaredoxin, a related-to-ubiquitin protein, and a pyruvate kinase-like protein, respectively, showed a distinct regulation pattern during the cold-acclimation process, and in some cases, their cold response seemed to be tissue specific. All three transcripts seem to be responsive to water stress as their levels were up-regulated with polyethyleneglycol treatment. DaRUB1 and DaPyk1 expression was up-regulated in leaf and crown, but down-regulated in roots from cold-acclimated plants. The significance of these results during the cold-acclimation process will be discussed. Deschampsia antarctica Desv. es la única monocotiledónea que prospera en las duras condiciones de la Península Antártica y representa un recurso invaluable para la identificación de genes asociados con la tolerancia a la congelación. Con el fin de identificar genes regulados por bajas temperaturas, hemos iniciado un análisis detallado de su expresión génica. Los geles 2D preliminares de proteínas foliares marcadas in vivo mostraron diferencias cualitativas y cuantitativas entre plantas aclimatadas al frío y no aclimatadas, lo que sugiere una expresión génica diferencial. De manera similar, se analizaron transcritos relacionados con la aclimatación al frío mediante un método de visualización diferencial. De los 38 ADNc identificados inicialmente, se caracterizaron tres clones de ADNc por su codificación de proteínas, patrón de expresión, respuesta a diversos tipos de estrés y expresión específica de tejido. El análisis Northern blot de DaGrx, DaRub1 y DaPyk1, que codifican una glutaredoxina, una proteína relacionada con la ubiquitina y una proteína similar a la piruvato quinasa, respectivamente, mostró un patrón de regulación distinto durante el proceso de aclimatación al frío. En algunos casos, su respuesta al frío pareció ser específica de cada tejido. Los tres transcritos parecen responder al estrés hídrico, ya que sus niveles aumentaron con el tratamiento con polietilenglicol. La expresión de DaRUB1 y DaPyk1 aumentó en las hojas y la corona, pero disminuyó en las raíces de las plantas aclimatadas al frío. Se discutirá la importancia de estos resultados durante el proceso de aclimatación al frío.
Tipo de Recurso	artículo original
doi	10.1007/s00792-003-0345-4
Formato Recurso	PDF
Palabras Claves	PIRUVATO QUINASA CITOSÓLICA RICINO ARABIDOPSIS THALIANA METABOLISMO DE PROTEÍNAS TOLERANCIA A LA CONGELACIÓN SISTEMA DE UBIQUITINA PLANTAS VASCULARES GLUTAREDOXINA EXPRESIÓN ADNc CYTOSOLIC PYRUVATE-KINASE CASTOR-OIL-PLANT ARABIDOPSIS-THALIANA PROTEIN-METABOLISM FREEZING TOLERANCE UBIQUITIN SYSTEM VASCULAR PLANTS GLUTAREDOXIN EXPRESSION CDNA análisis aclimatación al frío Deschampsia antarctica análisis de expresión génica analysis cold acclimation Deschampsia antarctica gene expression analysis
Ubicación del archivo	http://dx.doi.org/10.1007/s00792-003-0345-4
Categoría OCDE	Biochemistry & Molecular Biology Microbiology
Materias	PIRUVATO QUINASA CITOSÓLICA RICINO ARABIDOPSIS THALIANA METABOLISMO DE PROTEÍNAS TOLERANCIA A LA CONGELACIÓN SISTEMA DE UBIQUITINA PLANTAS VASCULARES GLUTAREDOXINA EXPRESIÓN ADNc CYTOSOLIC PYRUVATE-KINASE CASTOR-OIL-PLANT ARABIDOPSIS-THALIANA PROTEIN-METABOLISM FREEZING TOLERANCE UBIQUITIN SYSTEM VASCULAR PLANTS GLUTAREDOXIN EXPRESSION CDNA análisis aclimatación al frío Deschampsia antarctica análisis de expresión génica analysis cold acclimation Deschampsia antarctica gene expression analysis
Disciplinas de la OCDE	Botánica Biología Molecular Bioquímica
Versión del recurso (Recomendado-único)	version publicada
Tipo de ruta	hibrida
Access Rights	restringido
Derechos de acceso	restringido
Id de Web of Science	WOS:000187157100004
Título de la cita (Recomendado-único)	Identification and characterization of three novel cold acclimation-responsive genes from the extremophile hair grass Deschampsia antarctica Desv.
Identificador del recurso (Mandatado-único)	artículo original
Editorial	SPRINGER JAPAN KK
Categoría WOS	Biochemistry & Molecular Biology Microbiology Bioquímica y biología molecular Microbiología
Idioma	en
ISSN	1431-0651
Revista/Libro	EXTREMOPHILES
Identificador alternativo	PMID:12955601
Página de inicio (Recomendado-único)	459
Página final (Recomendado-único)	469
Formato	PDF