Repositorio UFRO · Omeka S

Genomic Insights into Phosphorus Solubilization of Pseudomonas extremaustralis

Primer Autor	Abanto, Michel
Título	Genomic Insights into Phosphorus Solubilization of Pseudomonas extremaustralis
Editorial	MDPI
Revista	MICROORGANISMS
Lenguaje	en
Resumen	Pseudomonas extremaustralis was first isolated from Antarctica and gained interest for its ability to thrive in extreme environmental conditions and degrade recalcitrant compounds. Some strains have been identified as phosphobacteria, which play a significant role in phosphorus (P) cycling by solubilizing or mineralizing insoluble phosphate forms for plant uptake. However, there is limited knowledge about the genomic mechanisms involved in P-cycling in the species P. extremaustralis. In this study, we aimed to evaluate the genomic potential of P. extremautralis as a phosphobacteria species by screening genes related to P-cycling. Two P. extremaustralis strains from pisciculture sludge residues were selected to sequence their complete genomes based on their ability to solubilize inorganic P in vitro, and an in silico analysis with all the P. extremaustralis genomes was performed to identify the presence of phosphorus-cycling-related genes. Genes mainly involved in the metabolic processes of two-component systems and transporters, and genes involved in organic acid production and alkaline phosphatases, were identified. This study helps us to understand the metabolic potential of this species and its role as a solubilizer of phosphates and thus a facilitator of plant-available phosphorus, which could guide the use of this species of phosphobacteria in the development of sustainable agriculture.Pseudomonas extremaustralis se aisló por primera vez en la Antártida y despertó interés por su capacidad para prosperar en condiciones ambientales extremas y degradar compuestos recalcitrantes. Algunas cepas se han identificado como fosfobacterias, las cuales desempeñan un papel importante en el ciclo del fósforo (P) al solubilizar o mineralizar formas insolubles de fosfato para su absorción por las plantas. Sin embargo, existe un conocimiento limitado sobre los mecanismos genómicos involucrados en el ciclo del P en la especie P. extremaustralis. En este estudio, nuestro objetivo fue evaluar el potencial genómico de P. extremaustralis como especie de fosfobacteria mediante el análisis de genes relacionados con el ciclo del P. Se seleccionaron dos cepas de P. extremaustralis provenientes de residuos de lodos de piscicultura para secuenciar sus genomas completos, basándonos en su capacidad para solubilizar P inorgánico in vitro. Posteriormente, se realizó un análisis in silico con todos los genomas de P. extremaustralis para identificar la presencia de genes relacionados con el ciclo del fósforo. Se identificaron genes principalmente implicados en los procesos metabólicos de sistemas de dos componentes y transportadores, así como genes relacionados con la producción de ácidos orgánicos y fosfatasas alcalinas. Este estudio contribuye a comprender el potencial metabólico de esta especie y su función como solubilizador de fosfatos, facilitando así la disponibilidad de fósforo para las plantas. Esto podría orientar el uso de esta especie de fosfobacteria en el desarrollo de una agricultura sostenible.
Tipo de Recurso	artículo original
Description	<italic>Pseudomonas extremaustralis</italic> phosphate-solubilizing bacteria whole-genome sequencing phosphorus-cycling genes
doi	10.3390/microorganisms13040911
Formato Recurso	pdf
Palabras Claves	SEQUENCE RESISTANT
Ubicación del archivo	http://dx.doi.org/10.3390/microorganisms13040911
Materias	SEQUENCE RESISTANT
Disciplinas de la OCDE	Microbiología Biotecnología agrícola Genética y Herencia
Versión del recurso (Recomendado-único)	versión publicada
Tipo de ruta	dorada verde
Access Rights	acceso abierto
Derechos de acceso	acceso abierto
Id de Web of Science	WOS:001475533600001
Título de la cita (Recomendado-único)	Genomic Insights into Phosphorus Solubilization of Pseudomonas extremaustralis
Identificador del recurso (Mandatado-único)	artículo original
Editorial	MDPI
Revista/Libro	MICROORGANISMS
Categoría WOS	Microbiology
Idioma	en
License	CC BY 4.0
Condición de la licencia (Recomendado-repetible)	CC BY 4.0
Entidad financiadora	Agencia Nacional de Investigacion y Desarrollo (ANID) of the Chilean government through FONDECYT Regular#Concurso Anillos de Investigacion en reas Tematicas#ANID#Agencia Nacional de Investigacion y Desarrollo de Chile (ANID)#Direccion de Investigacion, Universidad de La Frontera#Proyectos de Investigacion Vinculados a la Red Nexer#
Referencia del Financiador (Mandatado si es aplicable-repetible)	Agencia Nacional de Investigacion y Desarrollo (ANID) of the Chilean government through FONDECYT Regular Concurso Anillos de Investigacion en reas Tematicas ANID [ATE220038] Agencia Nacional de Investigacion y Desarrollo de Chile (ANID) [4236/2024] Direccion de Investigacion, Universidad de La Frontera [PP24-0001] Proyectos de Investigacion Vinculados a la Red Nexer [DNX22-0009] [1241293] [1251164]
Formato	pdf