Repositorio
Institucional

Cancino-Baier, David

FASN thioesterase domain mutation and fatty acid profile in Holstein Friesian intramuscular fat

COPERNICUS GESELLSCHAFT MBH

ARCHIVES ANIMAL BREEDING

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A mutation in the thioesterase domain of the FASN enzyme is associated with a lower percentage of myristic acid when the mutated allele is present, although the underlying mechanism remains unclear. The objective of this study was to evaluate, through in silico simulation, the effect of this mutation on the affinity of the catalytic site of the thioesterase domain for two of its ligands, myristoyl and palmitoyl, and its impact on the fatty acid profile of intramuscular fat. Animals were genotyped using PCR-RFLP, and fatty acid composition was assessed by gas chromatography. Simulations were conducted using the Bos taurus reference sequences (Q71SP7) from the UniProt database. Tertiary structures were generated through homology modeling using PHYRE2. The resulting models were refined with GalaxyRefine and evaluated by generating Ramachandran plots in SWISS-MODEL. Molecular docking was performed with AutoDock Vina. Four molecular dockings were conducted between both enzyme models, wildtype and mutated, and the ligands, resulting in the following combinations: wildtype/palmitoyl, mutated/palmitoyl, wildtype/myristoyl, and mutated/myristoyl. The interaction regions of the generated dockings were visualized using PyMOL software. A decrease in the percentage of myristic and palmitic fatty acids was observed in homozygous individuals with the mutated allele. The mutated/myristoyl complex showed a higher interaction compared to the wildtype/myristoyl complex. However, despite the increased affinity between the mutated enzyme and myristoyl, the possible alteration in the enzyme's structure is likely more relevant in affecting the fatty acid profile of intramuscular fat.Una mutación en el dominio tioesterasa de la enzima FASN se asocia con un menor porcentaje de ácido mirístico cuando el alelo mutado está presente, aunque el mecanismo subyacente aún no está claro. El objetivo de este estudio fue evaluar, mediante simulación in silico, el efecto de esta mutación en la afinidad del sitio catalítico del dominio tioesterasa por dos de sus ligandos, miristoilo y palmitoilo, y su impacto en el perfil de ácidos grasos de la grasa intramuscular. Los animales fueron genotipados mediante PCR-RFLP, y la composición de ácidos grasos se evaluó mediante cromatografía de gases. Las simulaciones se realizaron utilizando las secuencias de referencia de Bos taurus (Q71SP7) de la base de datos UniProt. Las estructuras terciarias se generaron mediante modelado por homología utilizando PHYRE2. Los modelos resultantes se refinaron con GalaxyRefine y se evaluaron generando diagramas de Ramachandran en SWISS-MODEL. El acoplamiento molecular se realizó con AutoDock Vina. Se realizaron cuatro acoplamientos moleculares entre ambos modelos enzimáticos, el de tipo silvestre y el mutado, y los ligandos, obteniéndose las siguientes combinaciones: tipo silvestre/palmitoilo, mutado/palmitoilo, tipo silvestre/miristoilo y mutado/miristoilo. Las regiones de interacción de los acoplamientos generados se visualizaron mediante el software PyMOL. Se observó una disminución en el porcentaje de ácidos grasos mirístico y palmítico en individuos homocigotos con el alelo mutado. El complejo mutado/miristoilo mostró una mayor interacción en comparación con el complejo tipo silvestre/miristoilo. Sin embargo, a pesar de la mayor afinidad entre la enzima mutada y el miristoilo, es probable que la posible alteración en la estructura de la enzima sea más relevante para afectar el perfil de ácidos grasos de la grasa intramuscular.

artículo original

10.5194/aab-68-271-2025

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DNA POLYMORPHISMS

COMPOSITION MUFA

SYNTHASE

MEAT

GENE

DOCKING

TISSUE

CLA

DNA POLYMORPHISMS

COMPOSITION MUFA

SYNTHASE

MEAT

GENE

DOCKING

TISSUE

CLA

Biología Molecular

Genética y Herencia

Ciencia Animal y lechería

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WOS:001483352300001

FASN thioesterase domain mutation and fatty acid profile in Holstein Friesian intramuscular fat

artículo original

COPERNICUS GESELLSCHAFT MBH

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Agriculture, Dairy & Animal Science

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