Genome sequence of a multidrug-resistant Corynebacterium striatum isolated from bloodstream infection from a nosocomial outbreak in Rio de Janeiro, Brazil

Primer Autor
Viana Vieira, Veronica
Co-autores
Ramos, Juliana Nunes
Rodrigues, Izabel dos Santos
Pereira Baio, Paulo Victor
Carneiro Veras, Joao Flavio
Juca Ramos, Rommel Thiago
Pacheco, Luis G. C.
Azevedo, Vasco Ariston
Hirata Junior, Raphael
Marin, Michel Abanto
de Mattos-Guaraldi, Ana Luiza
Título
Genome sequence of a multidrug-resistant Corynebacterium striatum isolated from bloodstream infection from a nosocomial outbreak in Rio de Janeiro, Brazil
Editorial
FUNDACO OSWALDO CRUZ
Revista
MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ
Lenguaje
en
Resumen
Multidrug-resistant (MDR) Corynebacterium striatum has been cited with increased frequency as pathogen of nosocomial infections. In this study, we report the draft genome of a C. striatum isolated from a patient with blood-stream infection in a hospital of Rio de Janeiro, Brazil. The isolate presented susceptibility only to tetracycline, vancomycin and linezolid. The detection of various antibiotic resistance genes is fully consistent with previously observed multidrug-resistant pattern in Corynebacterium spp. A large part of the pTP10 plasmid of MDR C. striatum M82B is present in the genome of our isolate. A SpaDEF cluster and seven arrays of CRISPR-Cas were found.
Corynebacterium striatum multirresistente (MDR) se ha citado con mayor frecuencia como patógeno de infecciones nosocomiales. En este estudio, presentamos el borrador del genoma de un C. striatum aislado de un paciente con infección del torrente sanguíneo en un hospital de Río de Janeiro, Brasil. El aislado presentó susceptibilidad únicamente a tetraciclina, vancomicina y linezolid. La detección de varios genes de resistencia a antibióticos es totalmente consistente con el patrón de multirresistencia observado previamente en Corynebacterium spp. Una gran parte del plásmido pTP10 de C. striatum M82B MDR está presente en el genoma de nuestro aislado. Se encontró un clúster SpaDEF y siete matrices de CRISPR-Cas.
Tipo de Recurso
Artículo original
Description
CAPES, CNPq, FAPERJ, FIOCRUZ, SR-2/UERJ.
CAPES, CNPq, FAPERJ, FIOCRUZ, SR-2/UERJ.
doi
10.1590/0074-02760180051
Formato Recurso
pdf
Palabras Claves
multidrug-resistant
Corynebacterium striatum
bloodstream infection
CRISPR-Cas
spaDEF cluster
multirresistente
Corynebacterium striatum
infección del torrente sanguíneo
CRISPR-Cas
Clúster spaDEF
Ubicación del archivo
http://dx.doi.org/10.1590/0074-02760180051
Categoría OCDE
Parasitology# Tropical Medicine
Materias
multidrug-resistant
Corynebacterium striatum
bloodstream infection
CRISPR-Cas
spaDEF cluster
multirresistente
Corynebacterium striatum
infección del torrente sanguíneo
CRISPR-Cas
Clúster spaDEF
Disciplinas de la OCDE
Microbiología
Genética y Herencia
Enfermedades Infecciosas
Versión del recurso (Recomendado-único)
version publicada
Tipo de ruta
diamante
verde
Access Rights
acceso abierto
Derechos de acceso
acceso abierto
Id de Web of Science
WOS:000438412400001
Título de la cita (Recomendado-único)
Genome sequence of a multidrug-resistant Corynebacterium striatum isolated from bloodstream infection from a nosocomial outbreak in Rio de Janeiro, Brazil
Identificador del recurso (Mandatado-único)
Artículo original
Editorial
FUNDACO OSWALDO CRUZ
Revista/Libro
MEMORIAS DO INSTITUTO OSWALDO CRUZ
Categoría WOS
parasitología
Medicina tropical
ISSN
0074-0276
Idioma
en
Referencia del Financiador (Mandatado si es aplicable-repetible)
CAPES
CNPq
FAPERJ
FIOCRUZ
SR-2/UERJ
Descripción
CAPES, CNPq, FAPERJ, FIOCRUZ, SR-2/UERJ.
Formato
pdf
License
CC BY
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85
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90
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Entidad financiadora
CAPES#CNPq#FAPERJ#FIOCRUZ#SR-2/UERJ
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