Repositorio
Institucional

Crainey, James Lee

Marin, Michel Abanto

Ribeiro da Silva, Tullio Romao

de Medeiros, Jansen Fernandes

Costa Pessoa, Felipe Arley

Santos, Yago Vinicius

Paulo Vicente, Ana Carolina

Bessa Luz, Sergio Luiz

Mansonella ozzardi mitogenome and pseudogene characterisation provides new perspectives on filarial parasite systematics and CO-1 barcoding

NATURE PORTFOLIO

SCIENTIFIC REPORTS

en

Despite the broad distribution of M. ozzardi in Latin America and the Caribbean, there is still very little DNA sequence data available to study this neglected parasite's epidemiology. Mitochondrial DNA (mtDNA) sequences, especially the cytochrome oxidase (CO1) gene's barcoding region, have been targeted successfully for filarial diagnostics and for epidemiological, ecological and evolutionary studies. MtDNA-based studies can, however, be compromised by unrecognised mitochondrial pseudogenes, such as Numts. Here, we have used shot-gun Illumina-HiSeq sequencing to recover the first complete Mansonella genus mitogenome and to identify several mitochondrial-origin pseudogenes. Mitogenome phylogenetic analysis placed M. ozzardi in the Onchocercidae "ONC5" clade and suggested that Mansonella parasites are more closely related to Wuchereria and Brugia genera parasites than they are to Loa genus parasites. DNA sequence alignments, BLAST searches and conceptual translations have been used to compliment phylogenetic analysis showing that M. ozzardi from the Amazon and Caribbean regions are near-identical and that previously reported Peruvian M. ozzardi CO1 reference sequences are probably of pseudogene origin. In addition to adding a much-needed resource to the Mansonella genus's molecular tool-kit and providing evidence that some M. ozzardi CO1 sequence deposits are pseudogenes, our results suggest that all Neotropical M. ozzardi parasites are closely related.

A pesar de la amplia distribución de M. ozzardi en Latinoamérica y el Caribe, aún se dispone de muy pocos datos de secuencias de ADN para estudiar la epidemiología de este parásito desatendido. Las secuencias de ADN mitocondrial (ADNmt), especialmente la región de código de barras del gen de la citocromo oxidasa (CO1), se han utilizado con éxito para el diagnóstico de filarias y para estudios epidemiológicos, ecológicos y evolutivos. Sin embargo, los estudios basados ​​en ADNmt pueden verse comprometidos por pseudogenes mitocondriales no reconocidos, como Numts. En este estudio, utilizamos la secuenciación shot-gun Illumina-HiSeq para recuperar el primer mitogenoma completo del género Mansonella e identificar varios pseudogenes de origen mitocondrial. El análisis filogenético del mitogenoma ubicó a M. ozzardi en el clado "ONC5" de Onchocercidae y sugirió que los parásitos de Mansonella están más estrechamente relacionados con los parásitos de los géneros Wuchereria y Brugia que con los del género Loa. Se han utilizado alineamientos de secuencias de ADN, búsquedas BLAST y traducciones conceptuales para complementar el análisis filogenético, demostrando que M. ozzardi de la Amazonía y el Caribe son casi idénticos y que las secuencias de referencia de CO1 de M. ozzardi peruanas, previamente reportadas, probablemente sean de origen pseudogénico. Además de aportar un recurso fundamental al conjunto de herramientas moleculares del género Mansonella y proporcionar evidencia de que algunos depósitos de secuencias de CO1 de M. ozzardi son pseudogenes, nuestros resultados sugieren que todos los parásitos neotropicales de M. ozzardi están estrechamente relacionados.

Artículo original

Los autores desean agradecer el apoyo financiero de la Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM), que brindó apoyo financiero para este trabajo con la subvención: 062.02005/2014. También nos gustaría agradecer el apoyo financiero de la Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM) y el Programa Pesquisa Sistema Unico de Saude (PPSUS) que brindaron apoyo financiero adicional con la subvención: 062.00647/2014.

The authors would like to gratefully acknowledge financial support from Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM), which provided financial support for this work with the grant award: 062.02005/2014. We would also like to gratefully acknowledge financial support from the Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM) and Programa Pesquisa Sistema Unico de Saude (PPSUS) which provided additional financial support with grant award: 062.00647/2014.

10.1038/s41598-018-24382-3

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Parasitology

Parasitología

Biología Molecular

Genética y Herencia

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WOS:000430280600010

Mansonella ozzardi mitogenome and pseudogene characterisation provides new perspectives on filarial parasite systematics and CO-1 barcoding

Artículo original

NATURE PORTFOLIO

SCIENTIFIC REPORTS

Parasitología

2045-2322

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FAPEAM 062.02005/2014

PPSUS 062.00647/2014

The authors would like to gratefully acknowledge financial support from Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM), which provided financial support for this work with the grant award: 062.02005/2014. We would also like to gratefully acknowledge financial support from the Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM) and Programa Pesquisa Sistema Unico de Saude (PPSUS) which provided additional financial support with grant award: 062.00647/2014.

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FAPEAM 062.02005/2014#PPSUS 062.00647/2014