Repositorio UFRO · Omeka S

Microbial Community Composition in Take-All Suppressive Soils

Primer Autor	Duran, Paola
Co-autores	Tortella, Gonzalo Viscardi, Sharon Javier Barra, Patricio Carrion, Victor J. de la Luz Mora, Maria Jose Pozo, Maria
Título	Microbial Community Composition in Take-All Suppressive Soils
Editorial	FRONTIERS MEDIA SA
Revista	FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
Lenguaje	en
Resumen	Gaeumannomyces graminis var. tritici (Ggt) is the main soilborne factor that affects wheat production around the world. Recently we reported the occurrence of six suppressive soils in monoculture areas from indigenous "Mapuche" communities, and evidenced that the suppression relied on the biotic component of those soils. Here, we compare the rhizosphere and endosphere microbial community structure (total bacteria, actinomycetes, total fungi, and ascomycetes) of wheat plants grown in suppressive and conducive soils. Our results suggested that Ggt suppression could be mediated mostly by bacterial endophytes, rather than rhizosphere microorganisms, since the community structure was similar in all suppressive soils as compared with conducive. Interestingly, we found that despite the lower incidence of take-all disease in suppressive soils, the Ggt concentration in roots was not significantly reduced in all suppressive soils compared to those growing in conducive soil. Therefore, the disease suppression is not always related to a reduction of the pathogen biomass. Furthermore, we isolated endophytic bacteria from wheat roots growing in suppressive soils. Among them we identified Serratia spp. and Enterobacter spp. able to inhibit Ggt growth in vitro. Since the disease, but not always pathogen amount, was reduced in the suppressive soils, we propose that take all disease suppressiveness is not only related to direct antagonism to the pathogen. Gaeumannomyces graminis var. tritici (Ggt) es el principal factor edáfico que afecta la producción de trigo a nivel mundial. Recientemente, reportamos la presencia de seis suelos supresores en áreas de monocultivo de comunidades indígenas mapuche, y evidenciamos que la supresión dependía del componente biótico de dichos suelos. En este estudio, comparamos la estructura de la comunidad microbiana rizosfera y endosfera (bacterias totales, actinomicetos, hongos totales y ascomicetos) de plantas de trigo cultivadas en suelos supresores y propicios. Nuestros resultados sugieren que la supresión de Ggt podría estar mediada principalmente por endófitos bacterianos, en lugar de microorganismos rizosfera, ya que la estructura de la comunidad fue similar en todos los suelos supresores que en los propicios. Curiosamente, encontramos que, a pesar de la menor incidencia de la enfermedad del pie en suelos supresores, la concentración de Ggt en las raíces no se redujo significativamente en todos los suelos supresores en comparación con los suelos propicios. Por lo tanto, la supresión de la enfermedad no siempre está relacionada con una reducción de la biomasa del patógeno. Además, aislamos bacterias endófitas de raíces de trigo que crecían en suelos supresores. Entre ellas, identificamos especies de Serratia y Enterobacter capaces de inhibir el crecimiento de Ggt in vitro. Dado que la cantidad de enfermedad, aunque no siempre la de patógeno, se redujo en los suelos supresores, proponemos que la supresión de la enfermedad en su conjunto no se relaciona únicamente con el antagonismo directo al patógeno.
Tipo de Recurso	Artículo original
Description	Este estudio contó con el apoyo de la Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica (CONICYT), el Proyecto de Iniciación FONDECYT n.° 11150540 del Gobierno de Chile y el apoyo técnico del Núcleo Científico y Tecnológico de Biorrecursos (BIOREN) de la Universidad de La Frontera. GT agradece el apoyo del FONDECYT n.° 1161713. This study was supported by the Comision Nacional de Investigacion Cientifica and Tecnologica (CONICYT), FONDECYT Initiation Project No. 11150540 from Chilean Government and technical support of the Scientific and Technological Bioresources Nucleus (BIOREN) from La Frontera University. GT thanks for the support by FONDECYT No. 1161713.
doi	10.3389/fmicb.2018.02198
Formato Recurso	pdf
Palabras Claves	Gaeumannomyces graminis microbial diversity suppressive soils take-all real time PCR Gaeumannomyces graminis diversidad microbiana suelos supresores tomarlo todo PCR en tiempo real
Ubicación del archivo	http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2018.02198
Categoría OCDE	Microbiology
Materias	Gaeumannomyces graminis microbial diversity suppressive soils take-all real time PCR Gaeumannomyces graminis diversidad microbiana suelos supresores tomarlo todo PCR en tiempo real
Disciplinas de la OCDE	Fitomejoramiento y protección vegetal Agricultura Microbiología
Versión del recurso (Recomendado-único)	version publicada
Tipo de ruta	dorada verde
Access Rights	acceso abierto
Derechos de acceso	acceso abierto
Id de Web of Science	WOS:000445011000001
Título de la cita (Recomendado-único)	Microbial Community Composition in Take-All Suppressive Soils
Identificador del recurso (Mandatado-único)	Artículo original
Editorial	FRONTIERS MEDIA SA
Revista/Libro	FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
Categoría WOS	Microbiología
ISSN	1664-302X
Idioma	en
Referencia del Financiador (Mandatado si es aplicable-repetible)	ANID FONDECYT Initiation 11150540 ANID FONDECYT 1161713
Descripción	This study was supported by the Comision Nacional de Investigacion Cientifica and Tecnologica (CONICYT), FONDECYT Initiation Project No. 11150540 from Chilean Government and technical support of the Scientific and Technological Bioresources Nucleus (BIOREN) from La Frontera University. GT thanks for the support by FONDECYT No. 1161713.
Formato	pdf
License	CC BY
Página de inicio (Recomendado-único)	164
Página final (Recomendado-único)	170
Condición de la licencia (Recomendado-repetible)	CC BY
Entidad financiadora	ANID FONDECYT Initiation 11150540#ANID FONDECYT 1161713